Akademiker til svampeafsnittet under Afdeling for Bakterier, Parasitter og Svampe

Har du en naturvidenskabelig akademisk uddannelse, og viden om svampediagnostik og -infektioner? Så er du måske vores nye kollega på Statens Serum Institut.

Jobbets indhold

Afsnit for Mykologi og Parasitologi hører under Afdeling for Bakterier, Parasitter og Svampe og er nationalt referencelaboratorium for de to mikrobiologiske specialer mykologi og parasitologi. Vi modtager prøver fra hele landet og fra udlandet og analyserer disse i samarbejde med instituttets øvrige afdelinger.

Din ansættelse vil være på svampesiden, hvor der arbejdes med en lang række klassiske- samt nye - diagnostiske metoder som:

• Dyrkning og mikroskopi af svampe
• Identifikation og påvisning af resistensmekanismer ved klassiske og molekylærbiologiske metoder.,
• EUCAST resistensbestemmelse af gær-, skimmel og hudsvampe.
• Diagnostisk PCR-baret påvisning af svampeDNA i primære prøver
• Sekventeringsbaseret typning af svampe
• Forskellige serologiske metoder
• Overvågning af alvorlige svampeinfektioner, forskning og udvikling

Du bliver tilknyttet den del af afsnittet, der beskæftiger sig med diagnostik for svampeinfektioner. Her vil din primære opgave være, at have ansvaret for den molekylære diagnostik af svampe, dvs. diagnostiske molekylære analyser inkl. karakterisering af dyrkede svampe, genotypning, resistensprofil og eventuelle underliggende resistensmekanismer. Herudover vil du deltage i afsnittets generelle mykologiske opgaver inkl. elektronisk svar registrering samt data udtræk.

Dette betyder, at du vil blive involveret i en række funktioner i afsnittet, herunder dyrkning og mikroskopi, serologiske metoder og stifte tæt bekendtskab med flere af de molekylærbiologiske metoder.

Derudover vil der være mulighed for fordybelse i delprojekter samt forskningsprojekter:

Svampediagnostik: Erfaring med identifikation af patogene gær, skimmelsvampe og dermatofytter ved brug af mikroskopiteknikker (lys- og fluorescensmikroskopi), dyrkning og MALDI-TOF. Solid erfaring med molekylærbiologiske metoder som Sanger-sekventering og real-time PCR. Vant til aseptisk arbejde og korrekt håndtering af patientprøver for at sikre høj diagnostisk kvalitet. Erfaring med resistensbestemmelse i overensstemmelse med EUCAST-retningslinjer.

Molekylærbiologi: Optimering og udvikling af PCR-protokoller til identifikation af svampe og detektion af resistensmekanismer. Erfaring med genotypingsteknikker som MLVA og MLST til differentiering og gruppering af svampegenotyper. Anvendelse af bioinformatikværktøjer som BLAST, sekvensalignment, sekvens-assembly og referencebaseret alignment til detektion af genmutationer. Konstruktion af fylogenetiske træer og taxonomisk klassifikation af svampe. Erfaring med software til visualisering af data, herunder clustering og datarepræsentation.

Forskning og videnskabelig formidling: Dokumenteret erfaring med forskning indenfor svampediagnostik og resistensmekanismer, herunder publicering af videnskabelige artikler. Erfaring med formidling og oplæring af teknisk personale i laboratoriet samt vejledning af andre sundhedsprofessionelle, både teoretisk og praktisk.

Kvalitetssikring af analyser: Erfaring fra akkrediterede diagnostiske laboratorier, herunder kvalitetssikring af analyser i overensstemmelse med ISO 17025-standarder. Implementering og vedligeholdelse af kvalitetskontrolprocesser, herunder validering og standardisering af laboratorieanalysemetoder. Sikring af høj nøjagtighed og troværdighed af testresultater samt udarbejdelse af afvigelsesrapporter og håndtering af korrigerende handlinger. Sikring af, at alle analyser opfylder relevante standarder og akkrediteringskrav.

LIMS (Laboratory Information Management Systems): Erfaring med anvendelse af LIMS til effektiv håndtering af prøver og præcis rapportering af testresultater. Implementering af opdaterede EUCAST-retningslinjer i LIMS, herunder revision af ECOFF-værdier og breakpoints for korrekt tolkning af MIC-værdier. Opsætning af analyser i LIMS, som understøtter et effektivt arbejdsflow og sikrer pålidelige prøvesvar. Trækning af data fra LIMS til videre datahåndtering og analyse, hvilket muliggør løbende optimering af laboratorieprocesser.

IT: Erfaring med avanceret anvendelse af Excel til datahåndtering, statistisk analyse og visualisering af data. Kendskab til relevante softwareværktøjer til analyse og præsentation af data.

Din baggrund

Du har en naturvidenskabelig akademisk uddannelse med viden om svampediagnostik og -infektioner. Derudover ser vi gerne, at du er:

• engagement og nysgerrighed
• grundig, selvstændig og struktureret
• har gode samarbejdsevner og lyst til at indgå i et mindre team
• innovativ
• kompetent i engelsk, både i skrift og tale.

Vi tilbyder
SSI er en arbejdsplads, der er internationalt anerkendt for at løse nationale og globale sundhedsopgaver. Du bliver en del af en organisation med 900 medarbejdere, der løfter meningsfulde opgaver, som styrker menneskers og dyrs sundhed gennem forskning og beredskab. Vores hverdag er præget af mange forskelligartede opgaver, åbne døre og et bredt samarbejde med engagerede og dygtige kollegaer.

Vi er en familievenlig arbejdsplads med en 37 timers arbejdsuge inkl. frokostpause og frugtordning. Derudover har vi bl.a. en aktiv idrætsforening (IK-SERA) med motionslokaler, personaleforening og en tilknyttet børnehave. Vi er centralt beliggende i København med gode offentlige transportmuligheder (bus og metro).

Lyder jobbet som noget for dig? 

Send os dit CV og ansøgning, vi beder dig om ikke at indsætte et foto i dit CV, da vi bestræber os for en mere inkluderende rekrutteringsproces med lige muligheder for alle vores jobansøgere.  

Vi forventer at afholde samtaler fra uge 15. 

Har du yderligere spørgsmål til stillingen eller ansøgningsprocessen kan du kontakte mig, Henrik Vedel Nielsen, [email protected], tlf. nr. +453268 3995. Du kan læse mere om, hvordan du ansøger og rekrutteringsforløbet på Job på SSI.

Dine ansættelsesvilkår  

Du bliver ansat som akademisk medarbejder efter gældende overenskomst mellem Finansministeriet og Akademikernes Centralorganisation.

Vi ser frem til at høre fra dig.