Bioinformatiker stilling inden for molekylærvirologisk forskning & udvikling

Har du erfaring med ny molekylærvirologisk diagnostik, overvågning og karakterisering af virusgener. Kunne du tænke dig at arbejde med molekylær virologisk udvikling? Så er det muligvis dig vi søger i Virus, Forskning & Udviklings Laboratoriet (ViFU) på Statens Serum Institut (SSI).

Jobbets indhold

Vi søger en medarbejder til at varetage opgaver i forbindelse med EU-projekter med fokus på spildvandovervågning, samt indgå i og bidrage til den igangværende udvikling af HIV-1 minoritets-resistensanalyser samt deltage i forskningsopgaver om virus evolution.

Dine primære arbejdsopgaver:

• Varetage opgaver i forbindelse med EU projekter med fokus på spildevandsovervågning samt infektionsberedskab Europa.
• Deltage i varetagelsen af rutine HIV-1 resistens assays samt videreudvikling af metoder til HIV-1 minoritets-resistensanalyser
• Indgå i et netværk med bioinformatikere fra andre dele af Statens Serum Institut
• Vejledning af laboranter og studerende
• Deltage i andre undersøgelser og opgaver i ViFU afsnittet, såsom undersøgelser og afrapportering af virus evolution (via. f.eks. BEAST), samt metagenomiske undersøgelser af miljøprøver, herunder spildevand
• Deltage i møder, symposier og konferencer af relevans for ViFU og VMS.

Din baggrund

Vi forestiller os, at du er bioinformatiker, biokemiker, molekylærbiolog eller lignende og har en Ph.D. med molekylærvirologisk fokus.

Endvidere forventer vi, at du har:

• Erfaring med eller kendskab til HIV-1 minoritets-resistensanalyser
• Dokumenteret molekylærvirologisk erfaring evt. med publikationsliste
• Erfaring med Oxford Nanopore og Illumina sekventering og/eller sekvensanalyse
• Kendskab til fylogenetiske/fylodynamiske analyser, værktøjer og metoder
• Erfaring med statistisk analyse (gerne med udgangspunkt i R).
• Erfaring med Unix platformen og bioinformatisk analyse af data fra, NGS baseret detektering/karakterisering af DNA og RNA virus.

Som person forventer vi, at du har gode samarbejdsevner. Derudover trives du i et miljø, hvor opgaverne er af stor samfundsmæssig relevans, og hvor der ofte er korte deadlines.

Om ViFU laboratoriet

ViFU udfører forskning og udvikling (F&U) i ny molekylær-virologisk diagnostik, overvågning og karakterisering af virusgener. ViFU udfører også udvikling af nye diagnostiske molekylærbiologiske metoder baseret på ddPCR, Crispr-Cas og NGS (Illumina og Nanopore) til diagnostik og overvågning af især eksotiske og emerging virus samt zoonotiske virus i mennesker og dyr.  

Derudover foretager laboratoriet molekylærepidemiologisk overvågning af eksotiske og emerging virus i samarbejde med SSI’s Epidemiologisk Afdeling.

ViFU laboratoriet omfatter 11 akademikere og seks laboranter. ViFU og VMS råder over et BSL-3 laboratorium.

ViFU er en del af Afdeling for Virus og Mikrobiologisk Specialdiagnostik (VMS), som omfatter ca. 120 medarbejdere fordelt på fem laboratorier og udfører diagnostik, overvågning og typing/sekvensering af virus og bakterier hos mennesker og dyr. VMS er det nationale laboratorium for diagnostik og overvågning i virusinfektioner inkl. regionalt WHO-center for influenza.

Om ansættelsen

Der er tale om en tidsbegrænset stilling med ophør den 31. december 2027.

Du bliver ansat efter gældende overenskomst mellem Skatteministeriet og Akademikernes Centralorganisation.

Kontakt os gerne
Få mere at vide om stillingen ved at ringe til afsnitsleder Morten Rasmussen på tlf.: 3268 8980.

Er du interesseret?

Klik på "søg stillingen" og send os din ansøgning med CV og eksamensbevis. Ansættelsessamtaler forventes afholdt i uge 32.